สารที่มีผลกระทบมากมายในร่างกาย มันออกจากเม็ดเลือดขาวบางชนิดในระหว่างการแพ้ จะทำให้หลอดเลือดเล็ก ๆ ถ่าง (ขยาย) และกลายเป็นที่รั่ว ซึ่งสามารถทำให้เนื้อเยื่อปูด นอกจากนี้ยังทำให้กล้ามเนื้อเรียบสัญญา กรดในกระเพาะอาหารจะทำ และอัตราการเต้นหัวใจเพิ่มขึ้น ฮิสตามีนจะใช้ในการทดสอบสำหรับโรคภูมิแพ้ โรคหอบหืด และหลั่งกรดในกระเพาะอาหาร มันเป็นสารสื่อประสาทชนิดหนึ่ง