Proces, v ktorom pečene používa jeden z dvoch hlavných enzým ciest zmena toxické látky, napríklad protinádorových liekov, menej toxická látka, ktorá je jednoduchšie pre telo vylučovať. Vo fáze II detoxikácia, pečeň buniek pridať látky (napríklad cysteín, glycín alebo molekúl síry) toxické chemické alebo drog, aby sa menej škodlivé.